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基因测序将如何发展?

villain/2023-03-19/6阅读 /0评论
基因测序将如何发展?简介:

基因测序将如何发展?

基因测序将如何发展?

基因组测序 这块未来应该会以第三代测序等长读长测序方法垄断。长读长可以大大降低基因组拼接的难度。无论是微生物组,还是复杂基因组(多倍体、多重复区),三代已优势尽显。表观遗传测序 这块得细分,DNA甲基化,三代方法可以直接测得修饰碱基,因此有优势。转录因子大部分为窄峰,二代比较适合。而RNA Poly II以及组蛋白修饰,大多为宽峰,三代应该没问题。小RNA测序,二代绝对优势项目。长读长没有任何用。靶向外显子组测序,三代优势项目。不但可以直接读取全长,也可以分析大规模的结构变异与重排。转录组测序ISO-seq  以三代测序为代表的长读长测序方法。该测序的目的是弄清整个转录组的序列、外显子构成在基因组上的位置、可变剪切模式等。但由于三代测序本身建库和测序的特点,导致它无法定量(不同的SMRT Cell,不同长度reads之间难以normalization)。RNA-seq  以二代测序为代表的短读长测序方法,由于可以做RNA定量,将仍占有一席之地。但由于RNA-seq原先相对于芯片平台的优势(新序列发现、可变剪切)被ISO-seq取代,将面临相关芯片产品的竞争。以上应该是科研视角。具体商业应用上,我个人比较倾向于定制芯片或者PCR Array等产品,优点是比较容易把平台做到封闭、稳定。再补充点其他的,因为老有人把测序成本降低幅度、测序速度来提摩尔定律。摩尔定律持续了半个世纪,许多外行觉得可能在测序上也会重演这一幕。我的观点是:摩尔定律形成原因是当时半导体物理理论的积淀远超当时的工业水平。

测序行业中国是全球的领军行业之一,随着测序技术不断的发展,超摩尔定律一次一次的刷新大家对测序成本的看法(从原来测一个人的30亿美金到现在的1000美金),测序仪的数据产出已经远远超出了分析的速度,测序仪目前已经是一套完整的解决方案了,进入的门槛已经降低了很多,基本仪器有厂商在销售,实验环节已经从原来的手工化到目前的半自动化,未来相信会逐步的全自动化的替代,信息分析仍有较高门槛,需要不断的学术资源的利用,发现,应用和可靠性测试,能成为商业项目是一个需要沉淀很久的过程。但是目前像国内产前项目就简单的多,信息分析的数据库已经门槛逐渐降低,分析已经高度自动化。

之前的测序主要服务于学术市场,客户都是学校科研机构。市场来自于国家经费,市场容量是有限的。这块的动向关注华大,高端测序服务市场占据很大份额,所以它在寻找其他的增长点,就是临床应用。前段时间在瑞金医院还看到了癌症检测的服务。对于目前的测序技术来说,没有难度,准不准还有待考证,最起码学术上是站得住脚的。费用相对于手术费来说,真得算便宜目前这块的公司开始出现。是一个兆头。至于怎么和医院更好的融合,我不知道。因为问题是,即使准确率很高,不可能查出来就切吧。既然趋势有了,那么就是一个行业规范的问题。

估值150亿IPO这家公司为何与腾讯、华为并称“深圳三宝”?

【被誉为“国内基因测序龙头”、“基因测序界的腾讯”的华大基因,今日正式过会,并有望在在一个月内登录A股。】

备受投资界热捧的华大基因要叩开二级市场的大门了。《21CBR》记者获得证实,证监会将在今晚发布创业板发审委会议公告,华大基因已于今日下午正式过会。

深圳华大基因股份有限公司递交的招股说明书显示,公司拟在深交所创业板发行不低于4000万股,筹资17.32亿元,所募资金将用于精准医学服务平台升级项目等5个项目建设。按照目前的发审节奏来看,华大基因有望在一个月内登陆A股。

华大基因的上市历程颇有些一波三折。15-16年间,华大基因首次递交IPO以中止审查告终,证监会显示中止情形为:申请文件不齐备等导致审核程序无法继续。

今年3月,华大基因再度冲击IPO。公开信息显示,华大基因的排队序号一度在短时间内从第65位跃升至第27位。3月14日,证监会网站披露了华大基因更新后的招股书。

然而,当晚证监会下发的“59问”《反馈意见》引来外界议论纷纷。意见显示,证监会就公司独立性、同业竞争及多次重组等共计59个规范性和信息披露问题向华大基因作出询问,上市进程因此再度搁置。

根据招股书,公司目前总股本3.6亿股,估算其发行价在43.3元左右,简单测算下来,华大基因当前总估值约为156亿元。这家在资本界与腾讯、华为并称“深圳三宝”的生物公司再度走到台前,而伴随着基因测序临床应用的日渐普及,生物科技市场也即将迎来规模式爆发。

孕妇成基因测序主流受益者

华大基因做基因测序起家,此番谋划上市的四大业务版块都与基因测序服务有关,而不包括测序仪的研发、生产和销售,相当于只是把测序服务业务打包上市。其中,生育健康类服务占比最高,2016年收入达9.29亿元,占比54.62%,且每年都有超过50以上的增幅,是此次上市主体的核心业务。

招股书中披露的主营业务收入构成

连年增长反映了C端用户对基因测序的猛增需求,其中“无创产前基因检测”是目前该领域最早产业化的大众基因产品。华大基因于2010年最先推出这项技术,通过采集孕妇外周血,提取血浆中的游离DNA,即可利用测序方法分析胎儿患染色体非整倍性疾病的风险率。

我国是出生缺陷高发国家,每年新增出生缺陷数约90万例,其中耳聋、先天性心脏病等新生儿疾病系高发项目;而基因检测可以为孕妇进行产前筛查,提供产前先天性缺陷和遗传性疾病诊断。孕妇和生育家庭无疑成了此项技术的主要受益者。

技术日益成熟、成本逐年下降也推动了用户市场的爆发。根据BBCRreseach的数据,2018年全球基因测序市场规模预计将超过110亿美元,年复合增长率为21.2%,中国是增长最快的国家之一。随着二胎政策的放开,华大基因有望在未来几年保持高速增长。

即将爆发的市场与黎明前的黑暗

华大基因IPO预披露也引发了概念股的不小震动。3月21日,ST天仪创上市新高,安科生物连日涨停,基因测序产业上下游多达26支股票因此受益。同一时间,华大在生育服务领域的主要竞争对手贝瑞和康也在谋求借壳上市公司ST天仪,与华大基因争抢国内“基因测序第一股”。

有意思的是,贝瑞和康、诺禾致源等多家对标企业均由前华大基因员工参与创办,这些公司在业内被戏称为“华小”。据不完全统计,目前全国涉及基因检测概念的公司已有600余家。在华大基因最主要的三个业务板块(生育健康服务、基础科研服务和复杂疾病服务),每一块都面临着众多“华小”们的围追堵截。

同花顺行情中心今日显示

纵观全球基因测序市场,上游仪器制造被illumina、lifetech等少数几个欧美公司垄断,国内基因测序市场的“战火”主要烧在壁垒不高的中下游服务端。在技术突破、成本降低、政策放宽等多个利好因素影响下,市场爆发的同时竞争也必将加剧。

为此,华大基因于2013年花费1.176亿美元收购了具备完整人类全基因组测序技术的美国公司Complete Genomics (CG),从而成为国内少数具备生产基因测序仪器资质的企业。

此外,除了主攻生育健康和药物研发类基因检测,华大在基础科研、农业、海洋和运动等领域也有多个布局,以全产业链的方式构建自己的生态圈,试图借此在即将爆发的市场前夜迎接第一道曙光。

产业链中低端的激烈竞争也令看似高含金量的生物科技行业呈现出“富士康模式”。在知乎上,有关华大基因工资低、体制落后等问题也引发了网友讨论。

事实上,基因测序行业确实属于技术密集型行业,但随着多个领域的应用落地,巨大的人力和生产成本也随之而来。面对竞争加剧和行业问题的双重夹击,被资本追捧的基因测序公司仍需避免自身头脑“过热”。

任重道远的华大和“华小”

现今的红火态势也非一蹴而就。出于技术安全考虑,国家药监局和计生委于2014年曾两次叫停基因测序临床应用,行业一度面临危机。此后,卫计委逐步启动该领域的试点工作,精准医疗也被正式纳入“十三五”规划,上升为国家级战略。

今年1月,《“十三五”生物产业发展规划》将基因检测纳入生物产业惠民工程,也直接推进了华大基因、贝瑞和康等基因测序公司的上市进程。

基因测序行业属于政府强监管领域,政策转向很大程度决定其发展轨迹。然而,即便跨过了政策这道坎,以华大基因为代表的生物科技公司仍然面临不小的挑战。

华大基因的科研能力在业内处于领先,是国内基因研究领域及承担对外技术输出的重要企业之一:多次入选世界顶级学术期刊《自然》的前5位中国科研机构,仅次于中科院、中国科技大学、清华和北大;发起并参与多个国际大型基因组学研究项目。2016年9月,国家基因库在深圳建成,由华大基因研究院负责运营,也是继美国、日本和欧盟之后全球第四个国家级基因库。

深圳国家基因库

然而,前沿科研成果如何转化为临床可应用的基因检测技术,并真正落地惠及民生,是基因产业在起跑阶段的一大难题。以应用最为普及的产前基因检测为例,目前国内单次检测费用普遍仍在3000-5000元之间,且大多不在地方医保体系内,价格仍是众多中国普通家庭被拒之门外的现实理由。

前沿技术的快速奔跑需要极高的计算力支持,对后端的技术支撑也提出了要求。2015年10月,华大基因与阿里云、英特尔联合成立精准医疗开放云平台,旨在加快基因测序的诊断和治疗时间。高性能的计算平台和人工智能底层技术加快了精准医疗的行业发展,但现阶段长达数周的检测和诊断时间并不能满足行业以及后市场的需求。

对华大及其衍生出的众多“华小”而言,未来能跑的多快并非单由自身决定,仍要依赖政策倾斜、相关行业协同推进以及受众的广泛接纳。此番上市成功或将加大中国在基因测序产业链的话语权,但华大与“华小”们的前路依旧任重道远。

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